23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2251 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  100 
 
 
561 aa  1142    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  47.04 
 
 
784 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  26.17 
 
 
845 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  26.15 
 
 
806 aa  97.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  24.85 
 
 
832 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  23.76 
 
 
735 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  38.71 
 
 
805 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  20.53 
 
 
799 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  20.81 
 
 
1009 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  24.69 
 
 
761 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.07 
 
 
503 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
759 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 
914 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  32.18 
 
 
977 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.07 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.27 
 
 
754 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.63 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
715 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.78 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  29.41 
 
 
452 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.26 
 
 
837 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.38 
 
 
935 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>