100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0309 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 914 aa  1828    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  28.71 
 
 		 917 aa  333  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 917 aa  293  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  27.14 
 
 		 892 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  26.77 
 
 		 924 aa  274  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 934 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 918 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 931 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 		 924 aa  131  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.89 
 
 		 929 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 923 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 927 aa  108  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.15 
 
 		 924 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 883 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 952 aa  97.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.37 
 
 		 935 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 900 aa  87.8  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01310  TPR domain protein  22.33 
 
 		 893 aa  82.4  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 955 aa  80.9  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 944 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  22.76 
 
 		 933 aa  73.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 884 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.42 
 
 		 860 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 880 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.12 
 
 		 864 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  22.08 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  21.53 
 
 		 931 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 873 aa  62.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1676 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.03 
 
 		 883 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 		 557 aa  57.4  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 886 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 808 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  20.11 
 
 		 937 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 750 aa  54.7  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 351 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.42 
 
 		 733 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 1838 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 263 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 571 aa  51.6  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.33 
 
 		 884 aa  51.2  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.59 
 
 		 1979 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.36 
 
 		 882 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 1421 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.42 
 
 		 882 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  21.85 
 
 		 880 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 738 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 263 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 245 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 3145 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 207 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 927 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 207 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  30.91 
 
 		 939 aa  48.9  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 886 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  38.1 
 
 		 729 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.42 
 
 		 561 aa  48.5  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 804 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 827 aa  48.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.38 
 
 		 2240 aa  48.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.15 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 565 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 988 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.04 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  34.62 
 
 		 561 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.78 
 
 		 1056 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  22.86 
 
 		 584 aa  47  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 800 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  32.26 
 
 		 979 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  43.28 
 
 		 498 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  35.8 
 
 		 396 aa  46.2  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 226 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.51 
 
 		 1067 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 410 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 208 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1127 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.25 
 
 		 887 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 1385 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  32.53 
 
 		 208 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  45.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 607 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 330 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 573 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 414 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 		 141 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  20.7 
 
 		 767 aa  45.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 		 612 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 399 aa  44.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 189 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 232 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 320 aa  44.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.11 
 
 		 563 aa  44.3  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 2262 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 351 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  23.53 
 
 		 321 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>