67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01310 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01310  TPR domain protein  100 
 
 		 893 aa  1789    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 918 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.12 
 
 		 929 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.48 
 
 		 1056 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  20.76 
 
 		 892 aa  61.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  38 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  24.14 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 917 aa  58.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 800 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.18 
 
 		 571 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 556 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 931 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 573 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 592 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 573 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 1069 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  31.53 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 402 aa  51.6  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.73 
 
 		 574 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  19.75 
 
 		 927 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.19 
 
 		 1022 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  30.97 
 
 		 590 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 1979 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 716 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0882  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 206 aa  50.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.411607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 886 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  29.66 
 
 		 575 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 573 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 581 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1121 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 620 aa  48.5  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 		 562 aa  48.5  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 1694 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 562 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 		 629 aa  48.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 952 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.75 
 
 		 262 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 		 839 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 786 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2447  TPR domain-containing protein  29.8 
 
 		 645 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  32.98 
 
 		 573 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 164 aa  46.2  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 324 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30.84 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 582 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 464 aa  46.2  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 573 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  29.75 
 
 		 520 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 584 aa  45.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.23 
 
 		 549 aa  45.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 572 aa  45.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 860 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 436 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.35 
 
 		 1213 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 		 988 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1276 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.08 
 
 		 560 aa  44.3  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 		 594 aa  44.3  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>