More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0438 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 164 aa  330  6e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 543 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 4079 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 935 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  35.06 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1069 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 927 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 743 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.39 
 
 		 836 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1138 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 602 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1276 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  28.24 
 
 		 331 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 716 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 297 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 297 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  31.54 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 		 1979 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 1694 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 523 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 3035 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 		 1056 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 699 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 1022 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.66 
 
 		 707 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 750 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 955 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1049 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 740 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 662 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 388 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 388 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.95 
 
 		 745 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 562 aa  60.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.71 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 635 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 711 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.07 
 
 		 397 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 465 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 3560 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 		 818 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.06 
 
 		 576 aa  57.4  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 4489 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 747 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 362 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  29.1 
 
 		 864 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.81 
 
 		 1007 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1094 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.67 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 827 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 		 1056 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.49 
 
 		 784 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 		 715 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1276 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 593 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.65 
 
 		 1056 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 1827 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  29.79 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 617 aa  54.3  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 512 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.35 
 
 		 417 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 466 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 414 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 523 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>