More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0828 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 886 aa  1756    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  41.95 
 
 		 886 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  40.84 
 
 		 883 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 860 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.07 
 
 		 884 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 884 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  32.16 
 
 		 864 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 883 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.02 
 
 		 882 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.02 
 
 		 882 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.81 
 
 		 929 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 934 aa  181  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 927 aa  164  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 955 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 923 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1676 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 924 aa  105  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 931 aa  104  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 632 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.41 
 
 		 892 aa  96.3  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 878 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 1694 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 786 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.25 
 
 		 935 aa  92.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 944 aa  91.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 808 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.95 
 
 		 639 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1421 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.95 
 
 		 810 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 900 aa  86.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.67 
 
 		 1979 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  22.13 
 
 		 924 aa  84.3  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.14 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.42 
 
 		 2240 aa  81.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 729 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.83 
 
 		 586 aa  80.5  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1069 aa  79.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 917 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 		 931 aa  79  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 927 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 673 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.09 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.12 
 
 		 1213 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 1154 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.51 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.51 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1178 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.38 
 
 		 4079 aa  72  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  19.88 
 
 		 924 aa  71.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.35 
 
 		 573 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.94 
 
 		 1067 aa  71.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 643 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  22.78 
 
 		 937 aa  70.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.42 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 952 aa  70.1  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 880 aa  70.1  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 505 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.31 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 2262 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  31.18 
 
 		 880 aa  68.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  24.23 
 
 		 824 aa  68.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 265 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.85 
 
 		 733 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.22 
 
 		 520 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.78 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 3172 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 3145 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.2 
 
 		 2059 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 1737 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.93 
 
 		 1056 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  19.72 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  34.48 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 2262 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  25.51 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>