More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0196 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 927 aa  1796    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  38.03 
 
 		 929 aa  555  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 931 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 923 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  33.51 
 
 		 924 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 934 aa  351  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 944 aa  271  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 952 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.4 
 
 		 935 aa  214  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 955 aa  210  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  24.35 
 
 		 918 aa  184  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  23.25 
 
 		 892 aa  181  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  26.29 
 
 		 933 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  22.94 
 
 		 917 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 883 aa  167  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  25.17 
 
 		 931 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.55 
 
 		 924 aa  160  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.41 
 
 		 884 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 860 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 917 aa  154  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.97 
 
 		 882 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 884 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  25.08 
 
 		 864 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  24.34 
 
 		 940 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.02 
 
 		 882 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  22.11 
 
 		 924 aa  121  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 873 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 767 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.34 
 
 		 937 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 886 aa  110  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 914 aa  108  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  25.03 
 
 		 924 aa  107  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 880 aa  105  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 786 aa  104  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 939 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.98 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.71 
 
 		 883 aa  102  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 878 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1676 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.98 
 
 		 586 aa  95.9  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.17 
 
 		 1979 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 		 1694 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 886 aa  88.6  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 4079 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.25 
 
 		 1067 aa  84.7  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.2 
 
 		 576 aa  82.8  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.05 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.4 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  22.34 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.31 
 
 		 1056 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.54 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.81 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 3035 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 		 553 aa  73.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 729 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 689 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 572 aa  72  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.49 
 
 		 818 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1069 aa  71.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25 
 
 		 745 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  25.78 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.88 
 
 		 2240 aa  69.7  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.74 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.49 
 
 		 3172 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 792 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.67 
 
 		 573 aa  67  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 643 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  34.65 
 
 		 672 aa  66.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.12 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.12 
 
 		 887 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 2262 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.75 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.2 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.36 
 
 		 988 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  35.25 
 
 		 590 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 607 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 599 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 448 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1094 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1406 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  25.28 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 1737 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>