More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1296 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  75.46 
 
 		 625 aa  854    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  59.01 
 
 		 587 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 594 aa  1176    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  53.52 
 
 		 616 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 584 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  57.43 
 
 		 574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  57.25 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  55.18 
 
 		 595 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  47.47 
 
 		 595 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  49.82 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  43.37 
 
 		 620 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  36.7 
 
 		 613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 607 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  36.43 
 
 		 607 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  36.83 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 613 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  36.98 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  36.61 
 
 		 606 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  34.7 
 
 		 635 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  32.45 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 571 aa  260  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 		 562 aa  253  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  33.21 
 
 		 642 aa  243  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 572 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 592 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  32.5 
 
 		 645 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 645 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 556 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  35.91 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  29.11 
 
 		 603 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 553 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 573 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 573 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  34.12 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 573 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  34.12 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.88 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  29.21 
 
 		 584 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  33.06 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.58 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  49.37 
 
 		 494 aa  156  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.65 
 
 		 574 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 594 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  33.13 
 
 		 591 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  46.84 
 
 		 495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  29.01 
 
 		 551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 559 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  33.73 
 
 		 559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 603 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 617 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  29.8 
 
 		 677 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.62 
 
 		 557 aa  99.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  31.16 
 
 		 593 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 566 aa  97.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 425 aa  97.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 		 621 aa  93.6  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 		 621 aa  93.6  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  31.17 
 
 		 583 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.03 
 
 		 594 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 		 592 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  36.03 
 
 		 592 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 595 aa  90.5  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 610 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 642 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 610 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 573 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 579 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 573 aa  88.2  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  28.82 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 581 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  34.56 
 
 		 593 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>