84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3639 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 396 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  29.5 
 
 		 398 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  31.22 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  31.47 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  31.49 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  27.15 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  27.99 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  27.48 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  27.72 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  25.69 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  27.68 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  27.42 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  27.46 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  27.42 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  28.89 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  27.34 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  27.34 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  27.34 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  27.34 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  25.45 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  27.08 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  27.08 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  27.41 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  23.78 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  27.36 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  25.2 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  27.15 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  28.39 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  27.69 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  27.37 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  24.87 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25.99 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  27.13 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  26.08 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.13 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  26.65 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  26.95 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.27 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  26 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  26.79 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  25.55 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  26.92 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  31 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  26.53 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  26.87 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  30.86 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  28.75 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  25.95 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  25.95 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  26.39 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.45 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  28.65 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  26.76 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  25.24 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  24.81 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  25.8 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  24.61 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  24.05 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  26.04 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  24.41 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  23.88 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  25.41 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  22.81 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  24.11 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  25.37 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  25.93 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  23.32 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  35.8 
 
 		 914 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  29.08 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 587 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2418  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.18 
 
 		 238 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  26.43 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  26.43 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>