55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0939 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  583  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  29.28 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  28.95 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 1385 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  25.19 
 
 		 1237 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 555 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 917 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 605 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.36 
 
 		 935 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.05 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.05 
 
 		 561 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 574 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 729 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  25 
 
 		 483 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 914 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.39 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 571 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 581 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.67 
 
 		 557 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.15 
 
 		 820 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 827 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.58 
 
 		 652 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  29.07 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 652 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 566 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  30.88 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 784 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  26.62 
 
 		 1315 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 632 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 755 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  33.85 
 
 		 826 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 722 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 647 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 209 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 		 405 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 645 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  26.37 
 
 		 475 aa  42.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 643 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>