More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0662 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 330 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 		 689 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 3145 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 762 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 878 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.02 
 
 		 810 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 566 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 366 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.18 
 
 		 764 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.54 
 
 		 1056 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 718 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 927 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 789 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 827 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.87 
 
 		 1979 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.92 
 
 		 725 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 818 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1421 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.17 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1297 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.19 
 
 		 1022 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.17 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.81 
 
 		 577 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 673 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.81 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.21 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 1737 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 1154 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.33 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.13 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.85 
 
 		 784 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 2240 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 486 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  20.23 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 3301 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 		 1034 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1094 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 3172 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 4079 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.46 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.57 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 626 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 686 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1676 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 792 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 620 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.29 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.98 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.01 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1005 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.1 
 
 		 837 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.98 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.82 
 
 		 622 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.35 
 
 		 1056 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 808 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 784 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 685 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 708 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 614 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 643 aa  72.4  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 700 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 1276 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 748 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 614 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 614 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.13 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 626 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 754 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 1061 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>