More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1987 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  100 
 
 
864 aa  1730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  47.29 
 
 
882 aa  755    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  47.23 
 
 
882 aa  753    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  49.53 
 
 
883 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  51.38 
 
 
860 aa  884    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  50.47 
 
 
884 aa  852    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.21 
 
 
884 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
886 aa  366  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.64 
 
 
883 aa  366  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
886 aa  344  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
878 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
931 aa  168  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
934 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 
988 aa  164  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.99 
 
 
810 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23 
 
 
929 aa  150  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.54 
 
 
1056 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.82 
 
 
1676 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.67 
 
 
729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
4079 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.52 
 
 
1022 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.86 
 
 
1056 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.01 
 
 
2240 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.96 
 
 
818 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
927 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
767 aa  125  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 
1694 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 
784 aa  121  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 
1069 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
573 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
927 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.13 
 
 
573 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.57 
 
 
632 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
620 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.13 
 
 
786 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
944 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.85 
 
 
573 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
847 aa  110  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
722 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 
632 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
572 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
729 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
827 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
566 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
1737 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
594 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.17 
 
 
1138 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
3145 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 
572 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 
3172 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
900 aa  101  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.71 
 
 
733 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
649 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.64 
 
 
1979 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
568 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 
567 aa  98.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.12 
 
 
935 aa  98.2  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
923 aa  97.4  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.75 
 
 
725 aa  97.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
1276 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
740 aa  95.1  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.19 
 
 
887 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 
605 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 
1421 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.53 
 
 
762 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.53 
 
 
762 aa  91.3  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.26 
 
 
917 aa  90.9  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  20.58 
 
 
892 aa  90.9  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 
924 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
543 aa  90.9  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
748 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
566 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.37 
 
 
561 aa  89.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.69 
 
 
936 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
824 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.54 
 
 
620 aa  89  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.14 
 
 
1154 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
284 aa  89  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.93 
 
 
1486 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.37 
 
 
561 aa  88.2  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
620 aa  88.6  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.61 
 
 
340 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
562 aa  87.8  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 
571 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
1049 aa  87  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
1178 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
732 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
808 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.65 
 
 
795 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 
639 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
3035 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 
265 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
643 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.44 
 
 
924 aa  82.4  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
265 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 
594 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>