More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0899 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
245 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0811  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.78 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1144  tetratricopeptide TPR_2  37.62 
 
 
282 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  0.0543411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 
589 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.82 
 
 
810 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
3145 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 
878 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.29 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
718 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
808 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 
581 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
762 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.49 
 
 
1056 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.49 
 
 
818 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0799  hypothetical protein  35.42 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00593495  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
605 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  31.19 
 
 
779 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.94 
 
 
784 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 
1022 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.64 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 
827 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.7 
 
 
832 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
277 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  37.36 
 
 
577 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.23 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 
1056 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  37.36 
 
 
577 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 
576 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
779 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 
988 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
203 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.9 
 
 
795 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.63 
 
 
875 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
685 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
750 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.44 
 
 
1764 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.79 
 
 
816 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
909 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.32 
 
 
937 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
649 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
441 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 
377 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.32 
 
 
594 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 
632 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
550 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.17 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.56 
 
 
725 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.87 
 
 
733 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
792 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
739 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.09 
 
 
865 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.15 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
700 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
3172 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.15 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.5 
 
 
462 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  32.98 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
566 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
363 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
374 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
573 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.66 
 
 
622 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 
887 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
363 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
392 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
395 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
620 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  32.26 
 
 
434 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
183 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.3 
 
 
620 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.87 
 
 
668 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
822 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
847 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  38.3 
 
 
559 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 
638 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
637 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0120  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
117 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.087317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 
689 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.71 
 
 
936 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
366 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
686 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  24.75 
 
 
799 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
362 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
1979 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
142 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
1737 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
1421 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
1406 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>