More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1755 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  100 
 
 		 321 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 629 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002652  Flp pilus assembly protein TadD  29.17 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.16 
 
 		 1022 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 		 988 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.49 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27 
 
 		 818 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 3145 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 934 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.16 
 
 		 784 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.96 
 
 		 1056 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 718 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 		 1056 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.96 
 
 		 810 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.75 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.75 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1676 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 733 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 		 1507 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 878 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.22 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.92 
 
 		 1044 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1252 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 827 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1039 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.5 
 
 		 878 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 689 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 968 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 		 1252 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 594 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 626 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 626 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 626 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 885 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1038 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.73 
 
 		 878 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  29.83 
 
 		 897 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 1050 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.03 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 		 3301 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 3172 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 		 624 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  24.56 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 751 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 		 758 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.6 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.62 
 
 		 929 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.01 
 
 		 1328 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 637 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 		 557 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1215 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.84 
 
 		 620 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 639 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.03 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.9 
 
 		 875 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.74 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.6 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1371 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1858  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.87 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>