More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1812 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  38.59 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  34.44 
 
 		 243 aa  91.3  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  33.11 
 
 		 222 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 3145 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 762 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.82 
 
 		 587 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  33.96 
 
 		 577 aa  67.8  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  33.02 
 
 		 577 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  34.48 
 
 		 545 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  36.75 
 
 		 603 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2959  cellulose binding, type IV  29.93 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  32.99 
 
 		 816 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 632 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1094 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  35.77 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1228  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 		 875 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 789 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 878 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 536 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 637 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0440  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 909 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 1105 aa  57.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 750 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 1138 aa  57.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 612 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 3560 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1028  TPR domain-containing protein  34.31 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 4489 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.13 
 
 		 780 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  30.33 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.63 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.27 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 739 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 808 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 1288 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  27.48 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 681 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.27 
 
 		 739 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.65 
 
 		 742 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.62 
 
 		 622 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 688 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1005 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  27.89 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.15 
 
 		 725 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  23.59 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 1421 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.17 
 
 		 816 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.27 
 
 		 739 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 601 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 3035 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0685  tetratricopeptide TPR_4  34.02 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.80167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 362 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 1450 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 556 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.97 
 
 		 708 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.4 
 
 		 810 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.29 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  33.94 
 
 		 559 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 714 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  31.19 
 
 		 614 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.29 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 708 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.29 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 828 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 133 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 754 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 1424 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 754 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 649 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 313 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 828 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 649 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 657 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1406 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.51 
 
 		 865 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 767 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 3172 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>