More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3565 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  36 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 189 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1228  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2959  cellulose binding, type IV  30.34 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 240 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 878 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0440  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.88 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.38 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  33.57 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 534 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.48 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 465 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 649 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.29 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.08 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 725 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1406 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 1486 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21931  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 732 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 		 2240 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 484 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 828 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 764 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 828 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 486 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.85 
 
 		 887 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 3035 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 739 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  24.44 
 
 		 407 aa  55.1  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.42 
 
 		 865 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 605 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 828 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.7 
 
 		 587 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  39.08 
 
 		 594 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.33 
 
 		 1677 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 685 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1094 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  37.8 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  32.18 
 
 		 514 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.03 
 
 		 706 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.56 
 
 		 622 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  39.76 
 
 		 344 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.95 
 
 		 603 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 1979 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 		 624 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  35.05 
 
 		 373 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 377 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  40.28 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 		 714 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 612 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 909 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 639 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.91 
 
 		 742 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 612 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 543 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  29.27 
 
 		 542 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 583 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.87 
 
 		 795 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 542 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 718 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.07 
 
 		 732 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  29.75 
 
 		 345 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.23 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.77 
 
 		 545 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1121 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  44.93 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 750 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 595 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 636 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 762 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 740 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.71 
 
 		 820 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>