More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2936 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  56.16 
 
 
208 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.17 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  54.68 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
187 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  49.49 
 
 
198 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.5 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.22 
 
 
190 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  44.22 
 
 
190 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  57.78 
 
 
196 aa  174  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  44.56 
 
 
216 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.54 
 
 
256 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  48.06 
 
 
215 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
214 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 
209 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
207 aa  121  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
319 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.46 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  32.77 
 
 
452 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1371 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  30.77 
 
 
299 aa  68.2  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
878 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.67 
 
 
1154 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 
405 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33.04 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
4489 aa  64.7  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
499 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
927 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 
1979 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
968 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1094 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.21 
 
 
626 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
3560 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
739 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  32.17 
 
 
661 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
542 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.21 
 
 
626 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 
810 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.77 
 
 
267 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.77 
 
 
706 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  29.5 
 
 
548 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
366 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
543 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
1827 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.47 
 
 
1676 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
409 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.17 
 
 
708 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
279 aa  62.8  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
1276 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
392 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
649 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.94 
 
 
1013 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
291 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 
746 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
740 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
762 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.91 
 
 
707 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
297 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.27 
 
 
739 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
4079 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
329 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.72 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
605 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  32 
 
 
837 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
718 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
732 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.4 
 
 
1138 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
767 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
670 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.67 
 
 
561 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.01 
 
 
820 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
1421 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 
314 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
301 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
1056 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
562 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
409 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
279 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  26.23 
 
 
1101 aa  58.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  29.41 
 
 
737 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
280 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 
836 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
3145 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3035 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.67 
 
 
561 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>