180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0737 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
235 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  31.58 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  30 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
808 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0192  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
416 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000308025  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31047  TPR-repeat containing protein  30.08 
 
 
342 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0237182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0830  hypothetical protein  29.57 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000551764  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1022 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4657  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.65 
 
 
416 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  36.59 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0233  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
415 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207631  unclonable  0.0000000000607109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
363 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 
992 aa  52.4  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 
1056 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
363 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
1421 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
505 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35 
 
 
266 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
589 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3725  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
415 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4285  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
415 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
988 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0265  hypothetical protein  28.89 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
415 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
319 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  31 
 
 
815 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  28.47 
 
 
436 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
573 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
818 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  25.35 
 
 
466 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 
1056 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
643 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.58 
 
 
1676 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 
616 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  28.97 
 
 
417 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0233  tetratricopeptide domain protein  28.36 
 
 
417 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000133281  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
266 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
750 aa  48.5  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
784 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
615 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 
364 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  28.36 
 
 
417 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4022  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  28.36 
 
 
417 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000167013  hitchhiker  0.0000372591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
632 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
451 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3567  tetratricopeptide region  27.19 
 
 
403 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.359938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
3145 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 
207 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
265 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
512 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  35.35 
 
 
694 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
503 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0230  tetratricopeptide domain-containing protein  28.36 
 
 
417 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000773017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  27.93 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.99 
 
 
883 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0217  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
417 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
615 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
638 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.91 
 
 
850 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.61 
 
 
1077 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0247  cytochrome c-type biogenesis protein CcmH  25.68 
 
 
417 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00131868  normal  0.0142008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  26.85 
 
 
648 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
612 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.18 
 
 
602 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
1371 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.37 
 
 
623 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
689 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.79 
 
 
620 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 
734 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26 
 
 
733 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
352 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 
729 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
285 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
267 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
758 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
800 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
271 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
164 aa  45.1  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  25.24 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
636 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>