More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2007 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  52.91 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  57.3 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  54.64 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.52 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  51.5 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  48.96 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  50.74 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  58.46 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.75 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 319 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  45.11 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1371 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 1276 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 366 aa  64.7  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 		 818 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 784 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 543 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.02 
 
 		 1056 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.78 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 329 aa  62  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 		 988 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 927 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 		 1022 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.41 
 
 		 820 aa  61.6  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.81 
 
 		 397 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 		 1056 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.47 
 
 		 1013 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 4079 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1297 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 740 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  26.58 
 
 		 1101 aa  58.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1694 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.03 
 
 		 581 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.31 
 
 		 738 aa  57.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1094 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 647 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.31 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1827 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 615 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1121 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 		 1240 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2057  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.827411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.34 
 
 		 707 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 670 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 1154 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 4489 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.85 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 649 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 992 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 662 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 		 452 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 795 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.52 
 
 		 706 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 1252 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.9 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  29.17 
 
 		 567 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 589 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.82 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>