More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2615 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  61.54 
 
 
187 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  61.62 
 
 
198 aa  247  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.22 
 
 
190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  55.68 
 
 
190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  49.16 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.51 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50 
 
 
208 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  48.39 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  49.21 
 
 
211 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
209 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
319 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
214 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 
256 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.58 
 
 
1676 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1371 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
543 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.17 
 
 
594 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
265 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
670 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
1297 aa  61.6  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.37 
 
 
837 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
389 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
236 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.87 
 
 
936 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
265 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
265 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
740 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.2 
 
 
1101 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  26.32 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
662 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
547 aa  59.3  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
4079 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
1827 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
266 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 
810 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00857  C-type cytochrome biogenesis protein  30.16 
 
 
337 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
927 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
240 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 
267 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  27.49 
 
 
436 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
878 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 
572 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06070  C-type cytochrome biogenesis protein  30.16 
 
 
337 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000967954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  33.04 
 
 
417 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
403 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1022  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 
572 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
320 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.62 
 
 
746 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.77 
 
 
732 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 
784 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
291 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  26.54 
 
 
761 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 
1022 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  30.34 
 
 
567 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
465 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
322 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
4489 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 
1056 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
3145 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
409 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 
1694 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
357 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
293 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
273 aa  54.7  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
430 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
711 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
388 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.2 
 
 
397 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 
339 aa  54.7  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
923 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
249 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
249 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
393 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 
451 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 
452 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
634 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 
436 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
1252 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.3 
 
 
623 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
2240 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>