More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2980 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.12 
 
 
208 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  96.08 
 
 
211 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  52.55 
 
 
187 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  51.98 
 
 
200 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.5 
 
 
190 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  48.08 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.26 
 
 
190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  46.94 
 
 
190 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  51.85 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 
216 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.6 
 
 
256 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  44.94 
 
 
215 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  44.7 
 
 
214 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
235 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
207 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
1827 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  38.18 
 
 
1676 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
927 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  34.17 
 
 
837 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
1276 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  37.96 
 
 
936 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 
452 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
878 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
543 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
649 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
746 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
562 aa  64.7  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.91 
 
 
1138 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.78 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 
810 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
4079 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.95 
 
 
594 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30 
 
 
706 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
265 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
762 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
371 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
265 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
870 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
279 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
670 aa  61.6  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 
409 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
4489 aa  61.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
301 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
739 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.99 
 
 
707 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.8 
 
 
1154 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
1022 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  25.17 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.8 
 
 
668 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.19 
 
 
635 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
349 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.33 
 
 
820 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
265 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 
711 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
740 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.8 
 
 
706 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  30.33 
 
 
542 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
291 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1421 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.86 
 
 
764 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.17 
 
 
397 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
1252 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
615 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 
1252 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.16 
 
 
503 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
1297 aa  58.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.17 
 
 
582 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
499 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.11 
 
 
1764 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30 
 
 
681 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
461 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
288 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
448 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
405 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
750 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.72 
 
 
732 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.7 
 
 
661 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
1371 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.38 
 
 
436 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
593 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.98 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.7 
 
 
623 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
909 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
162 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
586 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
711 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>