More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0996 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
499 aa  998    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5443  GUN4 domain protein  40.42 
 
 
526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 
649 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.36 
 
 
988 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.74 
 
 
1022 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.13 
 
 
542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.82 
 
 
818 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.82 
 
 
1056 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.67 
 
 
820 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  40.71 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 
784 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1623  GUN4-like  30.8 
 
 
562 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.484626  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.46 
 
 
706 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  37.42 
 
 
462 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1827 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  40.8 
 
 
706 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 
1056 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.12 
 
 
750 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
371 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.18 
 
 
738 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.73 
 
 
357 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
306 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.57 
 
 
237 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.3 
 
 
249 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.36 
 
 
406 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.3 
 
 
249 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.36 
 
 
406 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.64 
 
 
306 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.65 
 
 
581 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  36.18 
 
 
582 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
260 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 
261 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
1421 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.71 
 
 
560 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
279 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.06 
 
 
629 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  41.27 
 
 
233 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.73 
 
 
746 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
4489 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
289 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
605 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
1276 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
547 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  30.81 
 
 
415 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
295 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 
289 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.33 
 
 
269 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
301 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
927 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 
349 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
833 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  38.89 
 
 
539 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 
839 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
3560 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 
295 aa  90.9  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 
295 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
750 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.69 
 
 
1240 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  33.55 
 
 
369 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
556 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
3035 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
391 aa  88.6  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
356 aa  87.4  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 
778 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
543 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
308 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.26 
 
 
929 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
562 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.24 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.23 
 
 
635 aa  84  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
1094 aa  84  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
211 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 
707 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
210 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
280 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33.06 
 
 
266 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
731 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
343 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
615 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
810 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
762 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 
338 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
732 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.46 
 
 
1979 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>