More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2230 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 711 aa  1463    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 991 aa  278  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0513  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 924 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0170  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0061  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 780 aa  251  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 885 aa  225  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  41.32 
 
 		 246 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  37.39 
 
 		 247 aa  187  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  38.8 
 
 		 540 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  178  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  42.61 
 
 		 239 aa  172  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  39.71 
 
 		 252 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  36.1 
 
 		 236 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  34.35 
 
 		 234 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  34.35 
 
 		 234 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4979  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09050  hypothetical protein  29 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.06128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2527  glycosyltransferase  27.42 
 
 		 726 aa  90.1  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4969  glycosyltransferase  23.53 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27940  glycosyltransferase  26.45 
 
 		 739 aa  82.4  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3848  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5122  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.04 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5364  hypothetical protein  24.43 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5514  group 1 family glycosyl transferase  24.04 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08950  glycosyltransferase  25.48 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.691292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 187 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.18 
 
 		 370 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 190 aa  62  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  28.05 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 355 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26690  glycosyltransferase  25.44 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  29.79 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.88 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  31.78 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.01 
 
 		 1056 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 190 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 386 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 762 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 371 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1069 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 208 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.89 
 
 		 745 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 		 382 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  31.25 
 
 		 198 aa  55.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 436 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 360 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 871 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 		 465 aa  54.7  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 273 aa  54.7  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 363 aa  54.3  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 248 aa  54.3  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 169 aa  54.3  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 123 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 		 190 aa  54.3  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 502 aa  54.3  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 123 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 792 aa  53.9  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 200 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 713 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 385 aa  53.9  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  28.69 
 
 		 196 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 363 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 208 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 608 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 543 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 335 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 318 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 199 aa  53.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 370 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  25.1 
 
 		 358 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  23.81 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 216 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 279 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 		 524 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 3145 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  24.37 
 
 		 350 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 371 aa  52  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 589 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 329 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  22.46 
 
 		 361 aa  52  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 598 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 364 aa  51.6  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>