More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2255 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  39.16 
 
 		 543 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.46 
 
 		 836 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 927 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  40.65 
 
 		 1694 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1276 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  44.63 
 
 		 573 aa  99.8  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1138 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.77 
 
 		 397 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.21 
 
 		 560 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 388 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 388 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 602 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  94.4  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 244 aa  93.2  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.07 
 
 		 707 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  39.13 
 
 		 1007 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 562 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 632 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 344 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 4079 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  38.52 
 
 		 745 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 512 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  37.9 
 
 		 417 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  89  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.45 
 
 		 730 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 3035 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  35.43 
 
 		 398 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1069 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.9 
 
 		 1979 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.59 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.92 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 818 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 711 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1049 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.43 
 
 		 784 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 878 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.45 
 
 		 988 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 1013 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 1192 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.62 
 
 		 623 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 699 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.17 
 
 		 784 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  35.25 
 
 		 715 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 3560 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 617 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 		 1056 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.69 
 
 		 810 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.39 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.56 
 
 		 743 aa  77.8  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.75 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 		 1022 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 1276 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 486 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  75.1  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 3172 aa  74.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 467 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1094 aa  74.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.15 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 		 1056 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 662 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 605 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 955 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 750 aa  72.4  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.22 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 740 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1297 aa  72  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 828 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  32.86 
 
 		 542 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  31.4 
 
 		 519 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  24.7 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 471 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>