More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0668 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 209 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  61.27 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  49.74 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.54 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.15 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  42.34 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.34 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 187 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.34 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  37.12 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  36.13 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 319 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 878 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.65 
 
 		 810 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 699 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 329 aa  72  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 1276 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 		 818 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 543 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 4489 aa  64.7  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.83 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.57 
 
 		 820 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.77 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.09 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1094 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 		 1694 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 647 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 4079 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3035 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 1022 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  32.41 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 562 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.83 
 
 		 397 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1276 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 3560 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  37.08 
 
 		 564 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 784 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.3 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.97 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 836 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.36 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 988 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 634 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.91 
 
 		 1764 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  34.41 
 
 		 837 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 		 1056 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 764 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 716 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1676 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  31.86 
 
 		 661 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1297 aa  58.9  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.43 
 
 		 1979 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 670 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1371 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1406 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 409 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  34.12 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1192 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 		 1252 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 		 1252 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>