More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2231 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  55.47 
 
 
265 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  58.43 
 
 
265 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  55.91 
 
 
267 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  53.1 
 
 
265 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.71 
 
 
265 aa  284  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  54.3 
 
 
266 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  34.4 
 
 
272 aa  131  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.83 
 
 
632 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.46 
 
 
810 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  34.55 
 
 
725 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
927 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
681 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.58 
 
 
620 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.34 
 
 
1676 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
3172 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
909 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.74 
 
 
764 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.61 
 
 
887 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.84 
 
 
1694 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
620 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.95 
 
 
865 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.82 
 
 
577 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.1 
 
 
594 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.1 
 
 
626 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
1486 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
685 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
3301 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.99 
 
 
681 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
614 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
626 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
614 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
573 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
614 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
614 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
614 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
626 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.81 
 
 
577 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
739 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
362 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.44 
 
 
622 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
689 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
637 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.04 
 
 
340 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
543 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
3145 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.12 
 
 
936 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.51 
 
 
816 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
824 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
448 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.85 
 
 
676 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.35 
 
 
623 aa  93.2  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
4079 aa  92  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
1276 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
1252 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
1252 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
808 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 
565 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.51 
 
 
462 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.21 
 
 
837 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 
576 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
1192 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 
358 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.67 
 
 
603 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
615 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
1737 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.11 
 
 
875 aa  89  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 
586 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.95 
 
 
1007 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 
818 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
486 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 
1022 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
374 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
639 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
612 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
523 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
636 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 
639 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
637 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
406 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
406 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 
1056 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
448 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  23.81 
 
 
682 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.73 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.96 
 
 
602 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 
784 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.06 
 
 
832 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 
992 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
4489 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 
836 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1154 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.08 
 
 
732 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>