More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1578 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
602 aa  1219    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  38.32 
 
 
620 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.81 
 
 
681 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  37.6 
 
 
618 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.43 
 
 
627 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  39.45 
 
 
625 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  39.45 
 
 
625 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
615 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.14 
 
 
603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  35.52 
 
 
609 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
612 aa  163  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.77 
 
 
647 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
624 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
624 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
624 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  35.93 
 
 
661 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.8 
 
 
681 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  36.15 
 
 
758 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.52 
 
 
700 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.86 
 
 
641 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  35.59 
 
 
626 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.92 
 
 
638 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.72 
 
 
676 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.19 
 
 
625 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.69 
 
 
594 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
338 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
691 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  37.71 
 
 
623 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  31.49 
 
 
692 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  36.72 
 
 
668 aa  157  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.29 
 
 
613 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.5 
 
 
635 aa  156  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.08 
 
 
662 aa  156  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
502 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.69 
 
 
601 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.65 
 
 
602 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.4 
 
 
668 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.2 
 
 
715 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  35.32 
 
 
656 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.35 
 
 
658 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 
657 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  32.98 
 
 
736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.38 
 
 
632 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.62 
 
 
613 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.7 
 
 
584 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
520 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.94 
 
 
645 aa  154  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
657 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  34.89 
 
 
597 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
648 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.18 
 
 
657 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.8 
 
 
520 aa  151  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.45 
 
 
650 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
691 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.88 
 
 
579 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
557 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.2 
 
 
668 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.51 
 
 
664 aa  150  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.32 
 
 
693 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  34.72 
 
 
617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.85 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  35.02 
 
 
662 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.64 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  32.48 
 
 
634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
746 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
612 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  36.54 
 
 
325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
537 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 
690 aa  147  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  34.78 
 
 
621 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  32.37 
 
 
641 aa  146  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
598 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.75 
 
 
757 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
938 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.05 
 
 
598 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 
691 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  32.23 
 
 
667 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  34.85 
 
 
692 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.02 
 
 
653 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.98 
 
 
878 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.66 
 
 
604 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  32.62 
 
 
457 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
632 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 
736 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.83 
 
 
607 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
573 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
625 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  31.89 
 
 
618 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.96 
 
 
591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>