More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3556 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 362 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  41.09 
 
 		 816 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.98 
 
 		 810 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 		 681 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 		 878 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 909 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  43.43 
 
 		 685 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.98 
 
 		 632 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 637 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 		 739 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.5 
 
 		 725 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0937  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376157  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  39.42 
 
 		 603 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 626 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  43.16 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  40.54 
 
 		 764 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  44.09 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.53 
 
 		 622 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.02 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  26.73 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3247  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.89 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405912  normal  0.391395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.82 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.61 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  40 
 
 		 865 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 573 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 3145 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35.54 
 
 		 887 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 4489 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  39.22 
 
 		 875 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.12 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.64 
 
 		 1034 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 1005 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.33 
 
 		 661 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  35.78 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.5 
 
 		 585 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  37 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 1737 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  38.24 
 
 		 1154 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 754 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1827 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1022 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  37.37 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  37.78 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 833 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  38.26 
 
 		 594 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 750 aa  73.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  35.04 
 
 		 1213 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  38.26 
 
 		 780 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.97 
 
 		 795 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.51 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 718 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 		 818 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  34.91 
 
 		 594 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  37.23 
 
 		 681 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.76 
 
 		 1056 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 472 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 612 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 		 714 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 3301 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 979 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  38.3 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 654 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  34.17 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.95 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 1094 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 594 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 3172 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 602 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  43.81 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  30.22 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 714 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>