More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2933 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 576 aa  1184    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 686 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.77 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 643 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 587 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 581 aa  287  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 546 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 		 795 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 648 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 762 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 559 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 638 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 879 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 827 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  28.02 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  27.2 
 
 		 460 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.69 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 766 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 790 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  24.65 
 
 		 598 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 744 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  25.61 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 759 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  26.29 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 632 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  27.01 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 570 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.32 
 
 		 626 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.32 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 609 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  25.31 
 
 		 571 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 626 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.33 
 
 		 653 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.5 
 
 		 875 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 3145 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 602 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 637 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 847 aa  94  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.72 
 
 		 1022 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.11 
 
 		 832 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 594 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 909 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.16 
 
 		 560 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 818 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 274 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 718 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.54 
 
 		 1056 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 784 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.4 
 
 		 820 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 		 1737 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.3 
 
 		 733 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.72 
 
 		 1056 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 635 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 635 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 824 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.12 
 
 		 689 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.36 
 
 		 988 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 637 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 739 aa  84  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  33.95 
 
 		 887 aa  84  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  28.85 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.97 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.34 
 
 		 340 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>