More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1949 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 461 aa  949    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  43.79 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 1301 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 813 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 1078 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 768 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1253 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1439 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 		 1113 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1039 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 766 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 901 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 753 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 608 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 593 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  49.6 
 
 		 186 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 931 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 769 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 789 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 765 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 660 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 		 849 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1426 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  40.88 
 
 		 200 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 1276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 896 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 619 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 550 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  45 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  41.6 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  40.29 
 
 		 669 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  45.45 
 
 		 127 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 657 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 886 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 1032 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 1265 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 771 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1513 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 980 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 		 812 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 653 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 530 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 763 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 656 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  44.26 
 
 		 196 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  44.63 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 1039 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 909 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 878 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 559 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 737 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 644 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 984 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 783 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 1121 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 500 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  40.8 
 
 		 837 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 268 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 603 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 764 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 873 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 		 632 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 927 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 		 637 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 1111 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35 
 
 		 1338 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1425 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 921 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 650 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 1325 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 720 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1692 aa  90.5  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 287 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.09 
 
 		 804 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 647 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3517  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 535 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1309 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 685 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 2072 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.67 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 		 908 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  35.94 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 1045 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.61 
 
 		 1278 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>