76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3127 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  52.97 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  38.75 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.16 
 
 		 187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  34.11 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  41.33 
 
 		 428 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  41.33 
 
 		 433 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 426 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 357 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 357 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2528  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 535 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  34.23 
 
 		 603 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 553 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 534 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 952 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 405 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.7 
 
 		 545 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.71 
 
 		 733 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 878 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.09 
 
 		 810 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 574 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 614 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.19 
 
 		 883 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 399 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 409 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  39.68 
 
 		 708 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.5 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 1257 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2735  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00105552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  23.4 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 2651 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.4 
 
 		 398 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 339 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 		 474 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  29.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 331 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  26.27 
 
 		 2679 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 409 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.19 
 
 		 742 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  27.52 
 
 		 233 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 190 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 2240 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.59 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 		 433 aa  41.6  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 883 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  26.88 
 
 		 1004 aa  41.2  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>