More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0595 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  53.22 
 
 
645 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
795 aa  1588    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  49.02 
 
 
748 aa  600  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  42.12 
 
 
790 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  45.33 
 
 
715 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  41.19 
 
 
744 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
879 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
648 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
559 aa  276  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
759 aa  263  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
534 aa  230  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
878 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.22 
 
 
810 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
776 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 
576 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
686 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
827 aa  160  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
681 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
762 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
847 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 
766 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
3172 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
589 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 
632 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
643 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.51 
 
 
1694 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.92 
 
 
626 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.51 
 
 
795 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.92 
 
 
614 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.92 
 
 
614 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
614 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.92 
 
 
626 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
909 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.35 
 
 
626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 
614 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
3145 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
598 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.2 
 
 
620 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
620 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
615 aa  127  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
792 aa  125  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
641 aa  124  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
3301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.57 
 
 
725 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
685 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.91 
 
 
816 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 
1056 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.45 
 
 
875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
718 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
637 aa  115  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
828 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
3035 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
828 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.61 
 
 
733 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
824 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
1276 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 
818 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
636 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 
1022 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.57 
 
 
865 aa  112  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.5 
 
 
561 aa  111  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.5 
 
 
561 aa  111  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.49 
 
 
714 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
1737 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
617 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
612 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
714 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
1056 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
1421 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
828 aa  109  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
833 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
486 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
639 aa  108  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.27 
 
 
1154 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.86 
 
 
1676 aa  108  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.89 
 
 
764 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 
988 aa  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
587 aa  107  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
635 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
635 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
784 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
637 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
611 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  27.9 
 
 
546 aa  104  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
935 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
608 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
927 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.34 
 
 
622 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.26 
 
 
397 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 
556 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
3560 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
362 aa  101  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
543 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.12 
 
 
462 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
1406 aa  100  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.83 
 
 
887 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>