More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3157 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
744 aa  1446    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  46.72 
 
 
645 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  42.93 
 
 
790 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  43.65 
 
 
715 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  41.03 
 
 
795 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  41.29 
 
 
748 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
879 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
759 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
559 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
534 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
762 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  34.77 
 
 
598 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
827 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
686 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
878 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
643 aa  142  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.4 
 
 
810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
766 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 
576 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 
641 aa  131  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
909 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
589 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
602 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
681 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 
689 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.03 
 
 
733 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.41 
 
 
725 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
686 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
828 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.49 
 
 
764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
637 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.77 
 
 
795 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
828 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
581 aa  111  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
685 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
566 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
615 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
1737 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.5 
 
 
816 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.14 
 
 
714 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  29.58 
 
 
546 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
448 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
847 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
1406 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
1276 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.62 
 
 
875 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
3172 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.85 
 
 
865 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
632 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
3145 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
573 aa  103  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
718 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 
789 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
362 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 
614 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.4 
 
 
626 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.4 
 
 
626 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.95 
 
 
620 aa  102  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
593 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
614 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36 
 
 
614 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36 
 
 
614 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
4489 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36 
 
 
626 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
714 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
614 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
828 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
543 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
808 aa  98.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.1 
 
 
676 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
927 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
556 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
620 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.5 
 
 
622 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.51 
 
 
887 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.4 
 
 
603 aa  94.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.61 
 
 
1154 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 
1694 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
732 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
1421 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.6 
 
 
3301 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.05 
 
 
681 aa  91.3  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
594 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
739 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
955 aa  90.1  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.94 
 
 
832 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
448 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
1106 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
833 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
824 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 
818 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
643 aa  89.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.76 
 
 
587 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
988 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 
1022 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>