113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0584 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1091    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 641 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 686 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 776 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 648 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 589 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 645 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 587 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 643 aa  130  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 879 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 795 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 559 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  26.98 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 792 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 593 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 744 aa  96.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 827 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 585 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 715 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 556 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  26.27 
 
 		 572 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 790 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  25.05 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 638 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  32.07 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  22.15 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  24.7 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 654 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 657 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  24.44 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  27.45 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  29.1 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  23.72 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 602 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  27.75 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  28.21 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  29.66 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 697 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 708 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 697 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  29.61 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  34.01 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 812 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  36.23 
 
 		 672 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 273 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  25.68 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  22.77 
 
 		 503 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  31.51 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 4489 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  22.83 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  26.16 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3035 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 766 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  26.48 
 
 		 650 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 609 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 269 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 543 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 450 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3560 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 707 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  45.31 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 189 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 185 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  25.36 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 1737 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 270 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2357  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.83 
 
 		 610 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 270 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>