More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3602 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
556 aa  1113    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  35.55 
 
 
609 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
638 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
762 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 
576 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
586 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
544 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
648 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
536 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  28.9 
 
 
559 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 
641 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
534 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
792 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
645 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
686 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
827 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
643 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 
657 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
613 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
570 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
616 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
653 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
795 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 
654 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
581 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
790 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
759 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
879 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
715 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
708 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
610 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  27.12 
 
 
546 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 
657 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
585 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
744 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
593 aa  90.1  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  24.22 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
697 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
602 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
686 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  25.46 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.89 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
748 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  29.51 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  27.3 
 
 
598 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
575 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.84 
 
 
571 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  34.33 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
776 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
3145 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
639 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
878 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 
632 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  34.11 
 
 
640 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.83 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  23.81 
 
 
540 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
812 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  30.26 
 
 
430 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
927 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
1737 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
587 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
1421 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.43 
 
 
780 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 
818 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 
784 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  22.83 
 
 
582 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
685 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  26.18 
 
 
579 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.14 
 
 
725 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
637 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
311 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  28.72 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.2 
 
 
623 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
708 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.58 
 
 
708 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
542 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30 
 
 
622 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
750 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.77 
 
 
816 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
780 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.78 
 
 
1979 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
3172 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.19 
 
 
437 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
273 aa  57.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 
836 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 
699 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
566 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.22 
 
 
764 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  26.54 
 
 
420 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  31.25 
 
 
634 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
565 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
714 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.17 
 
 
875 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.29 
 
 
603 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>