289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1220 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
609 aa  1239    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 
576 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
544 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 
536 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 
559 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
589 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
762 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
879 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
613 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
645 aa  94  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
686 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
827 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
587 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
792 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
648 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  26.59 
 
 
582 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.04 
 
 
641 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
744 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
686 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
657 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  25.95 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  25.94 
 
 
571 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  32.17 
 
 
575 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  26.94 
 
 
579 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  25.63 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 
654 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
581 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 
653 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
759 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  23.01 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  36.79 
 
 
572 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.31 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
776 aa  73.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
739 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
909 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
638 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
681 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
685 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
750 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
878 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  25.41 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.47 
 
 
725 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 
708 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
810 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
766 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 
598 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
3145 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
748 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.86 
 
 
887 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
637 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
570 aa  64.3  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
3172 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
448 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.3 
 
 
816 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
534 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  25.31 
 
 
497 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
362 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
594 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 
632 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
217 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.32 
 
 
864 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
790 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 
363 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
657 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 
363 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
505 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  23.62 
 
 
575 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
612 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
486 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
583 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
559 aa  57.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.48 
 
 
676 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
311 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 
441 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
441 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
542 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
748 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
3301 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
399 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  29.17 
 
 
503 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
892 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.74 
 
 
622 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
485 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  23.83 
 
 
540 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.45 
 
 
865 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
714 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  27.27 
 
 
594 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
750 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
828 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
313 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
593 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
1737 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
968 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>