145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0656 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 639 aa  1297    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.06 
 
 		 699 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 766 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 657 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 827 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 570 aa  153  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 657 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 605 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 654 aa  143  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 638 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  29.28 
 
 		 566 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 792 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 602 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  27.76 
 
 		 575 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.16 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 697 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 708 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 812 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 697 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.32 
 
 		 540 aa  91.3  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.47 
 
 		 576 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  24.94 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.09 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  31.08 
 
 		 634 aa  67.4  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 265 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  24.48 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 265 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 559 aa  62  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  26.62 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  26.37 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  26.91 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 759 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 265 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  36.45 
 
 		 648 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.34 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 739 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 909 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 556 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 878 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.94 
 
 		 1694 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 208 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  25.38 
 
 		 499 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4083  Tetratricopeptide domain protein  35.4 
 
 		 571 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.446531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 362 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 1486 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 3172 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.74 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 927 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.71 
 
 		 603 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 		 810 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.2 
 
 		 266 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.24 
 
 		 682 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 641 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 681 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.73 
 
 		 865 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.38 
 
 		 267 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 3301 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  29.45 
 
 		 189 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 513 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 593 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 649 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 212 aa  48.9  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 649 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 748 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.81 
 
 		 887 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.32 
 
 		 1077 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  27.46 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 534 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 233 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 293 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 1737 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  22.77 
 
 		 640 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 457 aa  47.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 		 1034 aa  47.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 870 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  25.64 
 
 		 437 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 557 aa  47.4  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>