217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3305 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  90.06 
 
 		 653 aa  1123    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 654 aa  1318    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  47.89 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  39.96 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  39.93 
 
 		 575 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  36.3 
 
 		 566 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 697 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  34.82 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 697 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 762 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 827 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 766 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 812 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 708 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 		 699 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.96 
 
 		 540 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.41 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  24.45 
 
 		 559 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 576 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  27.25 
 
 		 634 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  25.8 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 645 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  26.3 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  25.8 
 
 		 648 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  25.78 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 643 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 878 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  24.51 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.07 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  25.91 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 1737 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 610 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 824 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  29.41 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  26.07 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  29.35 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 2240 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 795 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  28.65 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 274 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.89 
 
 		 1056 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 828 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 804 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.56 
 
 		 641 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 828 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 		 293 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  35.48 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  35.48 
 
 		 428 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 565 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 426 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 583 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 3145 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 602 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.77 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.73 
 
 		 795 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 566 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 1252 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 1252 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.11 
 
 		 883 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.95 
 
 		 875 aa  51.2  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  25.53 
 
 		 648 aa  51.2  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 685 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 313 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 473 aa  50.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 311 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  21.23 
 
 		 585 aa  50.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 330 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.62 
 
 		 725 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 988 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 759 aa  50.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>