66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1641 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1130    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  43.78 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  32.81 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  30.49 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  27.99 
 
 		 582 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  29.19 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.24 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 559 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  34.29 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 879 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  26.85 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 648 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 827 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 776 aa  73.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 744 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 593 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  23.06 
 
 		 540 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  30.67 
 
 		 503 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  33.81 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 657 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 762 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  45.74 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 795 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 766 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2663  hypothetical protein  35.22 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  27.48 
 
 		 437 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 581 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 		 715 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  23.53 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 585 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  31.34 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.26 
 
 		 610 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  32.86 
 
 		 575 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  26.33 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32557  predicted protein  40.26 
 
 		 614 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2544  hypothetical protein  27.32 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 602 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 217 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>