229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0666 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
575 aa  1128    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  63.35 
 
 
566 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  63.15 
 
 
566 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  51.76 
 
 
616 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 
657 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
657 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  47.78 
 
 
602 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  44.82 
 
 
697 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
638 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  45.08 
 
 
697 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 
570 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.15 
 
 
654 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 
653 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
762 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
792 aa  207  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
827 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
812 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
766 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.98 
 
 
699 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
639 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  28.6 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  27.32 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
613 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
534 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  27.56 
 
 
634 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 
576 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.09 
 
 
536 aa  94.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  27.13 
 
 
648 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  25.34 
 
 
499 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
586 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
686 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  26.02 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  24.04 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
686 aa  73.9  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
645 aa  73.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
643 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
715 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  25.29 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  32.34 
 
 
546 aa  67  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
235 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
288 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
559 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
790 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  39.17 
 
 
700 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
472 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
795 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.51 
 
 
780 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  28.82 
 
 
460 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  27.51 
 
 
648 aa  60.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  30.08 
 
 
650 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
748 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
824 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
362 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  35.03 
 
 
575 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
879 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
505 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 
598 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  23.03 
 
 
497 aa  57.4  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 
610 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
878 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
649 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
649 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
323 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
685 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
1038 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 
810 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
744 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 
847 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
502 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  34.31 
 
 
529 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 
626 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 
626 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
614 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
614 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
614 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 
614 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.45 
 
 
614 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.67 
 
 
865 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 
542 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
681 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.67 
 
 
795 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
639 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
556 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
542 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
739 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
808 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
583 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.84 
 
 
714 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  21.36 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.63 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
732 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  29.9 
 
 
531 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>