66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3222 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1103    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 609 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 559 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 586 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 613 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 536 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 593 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  22.74 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.62 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  25.92 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 686 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 827 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.97 
 
 		 725 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  27.39 
 
 		 572 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 792 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  24.89 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  22.04 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  19.97 
 
 		 638 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 589 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 879 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 240 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 277 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.49 
 
 		 622 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 643 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 927 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 739 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 598 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  29 
 
 		 639 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1082 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 597 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 288 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 909 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  35.9 
 
 		 503 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 750 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 697 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 		 648 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 790 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 297 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 193 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 297 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 681 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1127 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.44 
 
 		 810 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  33.67 
 
 		 1542 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.87 
 
 		 764 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 878 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1123 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  24.74 
 
 		 531 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>