216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3296 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 605 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0031  Tetratricopeptide repeat protein  35.29 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 690 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  30.34 
 
 		 690 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 286 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 286 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 286 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.44 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 		 2679 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 900 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 265 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.61 
 
 		 935 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 292 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  35.37 
 
 		 795 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 593 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 2262 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 643 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 396 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 632 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.12 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 718 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 827 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  30.19 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 587 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 2651 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 686 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 767 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 917 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.41 
 
 		 561 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 326 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 587 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 804 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.67 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 566 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.67 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 362 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.82 
 
 		 820 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.34 
 
 		 725 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 870 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.41 
 
 		 561 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 457 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 804 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 467 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 597 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 423 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 589 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 974 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.87 
 
 		 577 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  33.71 
 
 		 651 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 596 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 626 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.53 
 
 		 739 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  29.59 
 
 		 615 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.7 
 
 		 349 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 643 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 792 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1096 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 266 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  27.45 
 
 		 382 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 405 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.66 
 
 		 668 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 647 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 400 aa  45.1  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 931 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  27.45 
 
 		 392 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 725 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.96 
 
 		 732 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 283 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 955 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.05 
 
 		 577 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000563815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  34.72 
 
 		 475 aa  44.7  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.49 
 
 		 818 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 2262 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.36 
 
 		 924 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  26.15 
 
 		 767 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 878 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 885 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 781 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>