68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2696 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  928    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  38.29 
 
 
582 aa  279  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  29.6 
 
 
571 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  28.6 
 
 
572 aa  146  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  30.6 
 
 
575 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  29.56 
 
 
579 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 
576 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 
536 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
648 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
641 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
534 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  25.19 
 
 
559 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
879 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
605 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
686 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
776 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
570 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  28.83 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
686 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  32.57 
 
 
640 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  27.84 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  28.89 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
593 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
559 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
645 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
653 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 
544 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 
575 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
790 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
587 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2544  hypothetical protein  27.57 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  30.1 
 
 
546 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  24.31 
 
 
499 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  21.8 
 
 
613 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
759 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
654 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  22.48 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
638 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
589 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
827 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
602 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
708 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
697 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  35.34 
 
 
648 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  24.44 
 
 
650 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
748 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
744 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.02 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.33 
 
 
699 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
697 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 
795 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  24.07 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
792 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  35.24 
 
 
566 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
643 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
613 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  31.54 
 
 
566 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 
762 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
609 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2663  hypothetical protein  32.56 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
657 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
616 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 
715 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>