40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5160 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1291    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  23.53 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  34.64 
 
 		 572 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  28.89 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  31.03 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 879 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  31.58 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 792 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 759 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 776 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 762 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  32.67 
 
 		 546 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  25.58 
 
 		 503 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  25.11 
 
 		 579 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 827 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  33.07 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  23.47 
 
 		 437 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 639 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.34 
 
 		 653 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 790 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 654 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 570 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  27.94 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2544  hypothetical protein  25.07 
 
 		 506 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 575 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 748 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 795 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 613 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 605 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 645 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>