37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2731 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  991    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2663  hypothetical protein  62.5 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  27.84 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  30.77 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  30.67 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  31.17 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  24.92 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.85 
 
 		 536 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 587 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  26.54 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 559 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  30.65 
 
 		 575 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  27.03 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 593 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 634 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 759 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 641 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  30.25 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 790 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 776 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  21.99 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 654 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 534 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  25.5 
 
 		 613 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 879 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  23.38 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 686 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 589 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 609 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>