67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3174 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1266    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  33.57 
 
 		 648 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 708 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 827 aa  166  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 762 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  30.84 
 
 		 650 aa  151  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  31.56 
 
 		 648 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 812 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  28.7 
 
 		 580 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 657 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 653 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 570 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.77 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  33.1 
 
 		 483 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 654 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  26.95 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 697 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 657 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 699 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 536 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 766 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 697 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  24.89 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  26.58 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.12 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  24.68 
 
 		 499 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  30.62 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 748 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2731  hypothetical protein  31.25 
 
 		 503 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.76 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  31.97 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 744 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 879 aa  50.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  20.87 
 
 		 613 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  26 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  28.33 
 
 		 460 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 609 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 641 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  26.73 
 
 		 639 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  26.6 
 
 		 579 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  25.42 
 
 		 582 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 686 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.1 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.1 
 
 		 610 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 593 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  25.88 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 790 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>