28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3897 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1301    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  35.58 
 
 
650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  27.29 
 
 
580 aa  153  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  30.93 
 
 
648 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  31.56 
 
 
634 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
827 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
708 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
762 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  29.09 
 
 
483 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
792 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
812 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.24 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
639 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
638 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
657 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
657 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
697 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
602 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 
536 aa  50.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
653 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
587 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.97 
 
 
575 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  30.05 
 
 
566 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
616 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
790 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 
654 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
766 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>