More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3794 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 657 aa  1331    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  38.7 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 570 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 657 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  44.6 
 
 		 575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.35 
 
 		 653 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.31 
 
 		 654 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 605 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 		 616 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  40.95 
 
 		 566 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  41.9 
 
 		 566 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 762 aa  290  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 827 aa  279  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 697 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 792 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 697 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 812 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 708 aa  171  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 766 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 699 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.24 
 
 		 540 aa  143  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 536 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.11 
 
 		 576 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  27.18 
 
 		 634 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 643 aa  97.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  24.76 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  24.12 
 
 		 580 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 810 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 645 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1276 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 3145 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 878 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  26.1 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  24.96 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 614 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.3 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 		 1694 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  26.22 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 3035 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.78 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 732 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  28.44 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 833 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  22.46 
 
 		 650 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 3560 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 864 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.52 
 
 		 1979 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.1 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  26.87 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  31.03 
 
 		 233 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 879 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 927 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.53 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 162 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 		 632 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.66 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.93 
 
 		 1252 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>