56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0796 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  100 
 
 
648 aa  1281    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  33.8 
 
 
634 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
708 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
762 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
827 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
792 aa  171  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  29.98 
 
 
580 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  34.44 
 
 
650 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  31.24 
 
 
648 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 
812 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.4 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
657 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  35.1 
 
 
483 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
570 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
638 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  28.66 
 
 
566 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
697 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
654 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  27.02 
 
 
575 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
699 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
616 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
653 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.1 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
657 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
602 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  28.45 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
697 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
639 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  27.45 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
587 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
648 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
534 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
559 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  27.07 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  31.05 
 
 
575 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
879 aa  60.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  31.06 
 
 
460 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
645 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
686 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
759 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  26.55 
 
 
613 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
556 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  33.54 
 
 
572 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  27.88 
 
 
497 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
715 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
581 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
686 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
609 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
613 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.01 
 
 
437 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  26.77 
 
 
582 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
593 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>