More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3076 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
697 aa  1328    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  86.03 
 
 
697 aa  1021    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  44.5 
 
 
657 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  46.38 
 
 
575 aa  351  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  45.38 
 
 
602 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 
616 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  43.59 
 
 
566 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
638 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  43.22 
 
 
566 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
570 aa  266  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.74 
 
 
653 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.24 
 
 
654 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
605 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
762 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
827 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
792 aa  213  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
766 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
708 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
812 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 
699 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
639 aa  146  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.21 
 
 
540 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
715 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.8 
 
 
576 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  25.56 
 
 
580 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
643 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
556 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
586 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 
641 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  27.97 
 
 
634 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  27.31 
 
 
559 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
587 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
613 aa  97.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
718 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
645 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
3145 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
566 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
847 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
593 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.41 
 
 
1676 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
878 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
534 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.15 
 
 
733 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
810 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.98 
 
 
725 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 
689 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 
632 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
909 aa  84.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  26.17 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.46 
 
 
875 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
581 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.04 
 
 
764 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
685 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
573 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
790 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  27.5 
 
 
650 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
1421 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 
626 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
615 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
649 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  26.6 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.65 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
795 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
1005 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
744 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.37 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  25.85 
 
 
571 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.37 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
620 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
639 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.37 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.12 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.65 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 
635 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 
635 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.85 
 
 
837 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
750 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.61 
 
 
622 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
789 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.7 
 
 
816 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.46 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
828 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 
708 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
612 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
828 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
589 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>