More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3244 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 699 aa  1429    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 639 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 766 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  28.88 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 827 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  29.14 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 762 aa  145  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 570 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 697 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 653 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 638 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 654 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  26.82 
 
 		 566 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 657 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 792 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 616 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 686 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  26.54 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 697 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 708 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 643 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 812 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 589 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  25.16 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 810 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  60 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.48 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 1252 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 1252 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 4489 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.36 
 
 		 1694 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  23.76 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 3035 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 3145 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1276 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  25.05 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 750 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 543 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  31.13 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1094 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 613 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 715 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 748 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 		 632 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 1737 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 3560 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.89 
 
 		 832 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.5 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.38 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.44 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 583 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 3172 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 739 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 909 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 833 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 		 641 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 375 aa  62  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 637 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 681 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 714 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0443  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.94 
 
 		 764 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  21.95 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 759 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  33.67 
 
 		 1014 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  23.9 
 
 		 598 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 1486 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 		 818 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 784 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.94 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  24.24 
 
 		 580 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.47 
 
 		 708 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  44.59 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>